Mise à disposition d’outils autour de la bioinformatique
Avec le soutien de l’équipe technique du MCIA et de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), nous avons pu installer une série d’outils utilisés dans la communauté bioinformatique sur le cluster Curta.
Cela représente environ 300 logiciels allant de logiciels spécialisés (AbySS, Bowtie, Cutadapt, etc), à des environnements R, le tout sous plusieurs versions ; accessible via les commandes module habituelles.
Cette suite de logiciels évolue et va évoluer dans le temps, en s’appuyant sur la fédération de cluster de l’IFB.
- Les demandes de logiciels et le support sont assurés au travers du portail
- L’installation des logiciels est réalisée grâce à un dépôt collaboratif